La San Juan naît dans l'état du Colorado, au flanc des montagnes qui portent le même nom qu'elle. Elle passe au Nouveau-Mexique, puis entre dans l'Utah, quasiment par le coin sud-est de l'Etat. Avec, à Bluff, un débit annuel moyen de 71 m3/s (1/4 de la Seine à Paris), la San Juan est une rivière importante, dont l'eau maintient un peu de vie dans une régionparticulièrement aride. Les agglomérations établies au long de la San Juansont pourtant très espacées, d'autant plus qu'on s'éloigne des montagnes : la rivière s'est enfoncée dans le Plateau du Colorado, ce qui rend son accès difficile. De plus, depuis plus de 100 ans, la San Juan court dans la réserve Navajo. Traditionnellement, ces Indiens vivent sur leurs fermes dispersées, ce qui ne favorise pas la formation d'agglomérations. A la fin de sa course, la San Juan a creusé un canyon pour rejoindre le Colorado, enfoncé plus profondément dans le sol. Les derniers kilomètres du canyon sont noyés dans le lac Powell.

La San Juan à Mexican Hat, un des rares villages sur son cours moyen (10/85)
Site de l'US Geological Survey pour l'eau : http://www.water.usgs.gov
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